השערת השוק היעיל (EMH) מתנגשת עם ניתוח יסודי, בשל הנחותיה לגבי זמינות המידע והרציונליות של השוק.
ניתוח יסודי דורש הערכה יסודית של מצבה הכספי של החברה ואת לקוחותיה. בהתבסס על שילוב כלשהו של מיומנות וגישה לנתונים, משקיע צריך להיות מסוגל להפיק הערכה עבור כל השקעה פוטנציאלית עם עין כלפי רכישת מניות כי הם underroalued בשוק.
- <->EMH מניחה שלושה דברים: כל המידע זמין לשוק, כל המשקיעים הם רציונליים ומניות בצע הליכה אקראית. ההנחה על מידע באה בשלושה טעמים עם אמצעים שונים של כוח.
תחת טופס חזק של EMH, מידע משותף אוניברסלית ומשתקף מיד במחירי המניות. במצב זה אין הבחנה בין מידע פרטי לציבור לבין מידע לציבור, ומחיר המניה משקף באופן מדויק לחלוטין את תזרימי המזומנים העתידיים הצפויים של החברה. במצב זה, ניתוח היסוד הוא חסר תועלת, כי השילוב של מידע מושלם ומשקיעים רציונליים אומר כי מחיר המניה תמיד משקף את המחיר המהותי.
תחת טופס חצי חזק של EMH, כל המידע הציבורי הוא הניח להיות משולב במחיר המניה כמעט מיד. במקרה זה יש פוטנציאל למחירי המניות להיות לא מדויק או מיושן בגלל מידע פרטי שעדיין לא היה משותף. המשמעות היא שיש פוטנציאל מוגבל לניתוח יסודי לעבוד כאשר הוא מבוסס על גישה למידע פרטי מדויק יותר.
תחת טופס חלש של EMH, רק מידע בשוק הציבורי הוא שילב להיות משולב במחיר המניה. אם יש חדשות חמות על חברה, EMH החלשה מניחה שהיא מעוכלת במהירות על ידי השוק וכי השינוי במחיר משקף במדויק את ההשלכות של החדשות. מידע ציבורי ופרטי אחר אינו אמור להיות חלק מהמחיר, דבר המרמז על כך שיש פוטנציאל רב יותר לניתוח יסודי לעבוד כאשר הוא מבוסס על יתרון מידע. תחת כל הצורות של EMH, המשקיעים מניחים שהם רציונליים לחלוטין, והערכת השווי של מלאי מסוים מניחה שהוא מדויק על סמך המידע הקיים. בהינתן אותו מידע, לכל אנליסט או משקיע יש את אותה הערכה. אחת המכות הגדולות נגד EMH היא כי כמה משקיעים באופן שגרתי לנצח את השוק, במיוחד וורן באפט.
המשמעות היא כי יש אנשים שיש להם מידע טוב יותר מאחרים או שיש אנשים טובים יותר בפירוש מידע יותר מאחרים.רעיון זה נתמך על ידי מחקר בתנועות שוק ומימון התנהגותי, אשר שניהם מראים כי מחירי המניות לא תמיד משקפים ערך כלכלי. בעוד EMH נותרה היפותזה חשובה בספרות הפיננסית, היא איבדה לאחרונה משיכה.