ETF הם כלי השקעה עם תוכניות השקעה גמישות. לכן הם מושכים יותר לאחוז גדול יותר של משקיעים, הן סוחרים פסיביים והן פעילים. הם גמישים מטבעם ונראים כאפשרויות טובות יותר מאשר עתידיים. גודלה של השקעה יכול להיות קטן יותר עם תעודות סל, והוא יכול לכלול אמות מידה ללא חוזים בעתיד. בנוסף, תעודות סל אינן דורשות חשבונאות מיוחדת, שוליים, עלויות גלגול או כל תיעוד מיוחד.
-> ->תעודות סל הן כלי ההשקעה המועדף עבור סוחרים בקרנות גידור משום שהן כלי נוח למסחר, באופן דומה למניות. קרן אינדקס אינה יכולה להתאים לגמישות המסחר או השוליים באופן שבו מניות או תעודות סל. תעודות סל יכולות גם להיות נסחרות באמצעות מכירה בחסר, אשר לא ניתן לעשות עם המניות, אלא אם כן המסחר הסגירה מוקדם יותר של המניה היתה עלייה במחיר שלה.
לעומת זאת, קרנות האינדקס הן קרנות פשוטות לניהול, ומשקיעים פסיביים, במיוחד אלה במגזר הקמעונאי, לא צריכים פיקדונות או ישות תיווך לטפל קרנות אלה. קרנות אינדקס ניתן לרכוש בקלות דרך הבנקים, אשר שומר על רכב השקעה זה פשוט מספיק כדי להיות הרכב המועדף על המשקיעים הקמעונאיים ביותר.החלטה על כלי ההשקעה האופטימלי תלויה בעלויות תפעול השוואתיות. המשקיע הממוצע עשוי להחליט ללכת עם קרנות אינדקס בשל הקלות היחסית שלהם המבצע, ואילו מוסדות ואנשים המסחר באופן פעיל רשאי לבחור עבור תעודות סל כגון קרנות נאמנות בשל היתרונות הגלומים של התשואות על פי מדד השוק. היו מקרים שבהם אפילו גורואים ההשקעה כגון וורן באפט, שיש להם ידע נרחב של יסודות ההשקעה ואת ההשקעה ערך ראוי, בחרו קרנות אינדקס מעל תעודות סל. הם מייעצים תוכנית השקעה מערכתית של קניית כספים באופן קבוע על פני תקופה של זמן ממוצע נדנדה בערכים הקרן.